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2012年6月新疆沙湾县某奶牛养殖场爆发疑似牛乳头状肿瘤病,为了确诊该病,本研究采取皮肤病变组织进行病理切片检查;设计牛乳头状瘤病毒简并引物BPVP1/BPVP2对皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体中进行测序、序列分析及遗传进化树构建。结果表明:遗传进化树分析显示新疆沙湾县爆发的牛乳头状肿瘤病是由2型牛乳头瘤病毒所引起,与BPV-1、BPV-13进化关系最近。本研究为新疆地区牛乳头状瘤的科学防控提供了理论依据。