【摘 要】
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基序查找是生物信息学中的一个重要问题,由于生物序列中大多数信号的复杂性,一直没有很好的模型或可靠的算法来求解这一问题.本文提出了一种基于统一投影和邻居桶聚集提炼策
【基金项目】
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国家自然科学基金重点项目（60433020）资助,新世纪优秀人才支持计划项目（NCET-05-0683）资助,长江学者和创新团队发展计划项目（IRT0661）资助.
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基序查找是生物信息学中的一个重要问题,由于生物序列中大多数信号的复杂性,一直没有很好的模型或可靠的算法来求解这一问题.本文提出了一种基于统一投影和邻居桶聚集提炼策略的基序查找算法UPNT（Uniform Projection with Neighbourhood Thresholding）.在UPNT算法中,利用统一投影策略有效减少了投影数目,并使用邻居桶聚集提炼的策略大大减少了提炼桶的数目.本文进一步使用背景分布均衡与非均衡的合成（l,d）序列两套数据集对算法性能进行测试和分析,实验结果表明：UPNT在
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