枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类(CAZymes)的分布与进化分析

来源 :西南农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hellobluejay

【摘要】

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【目的】分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义。【方法】利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测。【结果】明确枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的数量为57个,分别为27个GH、21个CBM、2个CE、4个PL、1个GT和2个GH/CBM。同时,通过对上述CAZymes进行遗传关系分析,明确存在GH/PL/CBM、GH/CBM、GH/CBM/CE/PL、GH/CBM/CE/PL/GT等大的类别

【作者】

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祝友朋韩长志

【机构】

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西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【出处】

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西南农业学报

【发表日期】

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2021年6期

【关键词】

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枯草芽孢杆菌BEST195 碳水化合物活性酶预测程序遗传关系

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(31960314),云南省应用基础研究计划项目(2018FG001-028),西南林业大学大学生创新创业项目(201825)。

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