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传统农业与现代农业相比，无论是生产方式还是品种类型均凸显自然的要素。例如，传统农业利用粪料及杂物等秘肥施于土壤，能够得到自然分解。而现代农业使用的化肥农药是土壤和水难以分解的，使用不当都会造成土壤中毒和水污染。再如育种技术，传统育种以自然变异为主，现代农业则采用转基因、多元杂交等方法人为改变作物的遗传结构。