隐马尔可夫模型-改进的预测蛋白质二级结构方法

来源 :生物数学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:q569293407
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引入蛋白质二级结构预测的新方法:隐马尔可夫模型.其中将蛋白质的二级结构分成三类:H(指α-螺旋),E(β-折叠)及O(包括转角,卷曲及其他结构).该方法属于统计方法,但考虑了相邻氨基酸之间的相互作用(体现在状态传输概率).通过模型的改进及参数的确定后,我们编制了程序HMMPS.用它来预测蛋白质二级结构,具有很高的准确度.其中关于H,E和O的准确率分别达到80.1%,72 0%和63 2%.这表明,我们的方法是较为可靠的.
其他文献
目的:通过较大样本的人群血清学筛查,探讨中国人群孕早期PAPP—A、Fβ-HCG的中位数,提高唐氏综合征检出率.方法:对3854例9-13周的孕妇,应用时间分辨荧光免疫法进行血清PAPP—A、Fβ