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一种新的图划分算法在PPI网络模块化中的研究
一种新的图划分算法在PPI网络模块化中的研究
来源 :山西农业大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:game1980
【摘 要】
:
为了探测一组连接紧密的功能模块以便为蛋白质的功能预测提供许多有用的信息,提出了一种基于蛋白质相似度的图划分聚类算法,基于节点间最短路径数构建度量函数,以及模块度最
【作 者】
:
王晓芳
贾宗维
【机 构】
:
晋中师范高等专科学校,山西农业大学信息科学与工程学院
【出 处】
:
山西农业大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2012年6期
【关键词】
:
蛋白质交互网络
功能模块
模块度
聚类
Protein-protein interaction networks
Functional modules
Mo
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为了探测一组连接紧密的功能模块以便为蛋白质的功能预测提供许多有用的信息,提出了一种基于蛋白质相似度的图划分聚类算法,基于节点间最短路径数构建度量函数,以及模块度最优化作为算法终止条件。结果表明该算法能够较为准确地发现稠密的蛋白质功能模块。
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