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新疆巴仑台铁铜矿赋存于华力西期中酸性侵入岩与碳酸盐的接触带上，矿体形态以似层状、透镜状为主。围岩蚀变主要有矽卡岩化、绿泥石化、绿帘石化、硅化。矿石矿物以磁铁矿、黄铁矿、黄铜矿为主，脉石矿物中有典型的矽卡岩矿物透辉石、石榴子石。矿床成因类型为矽卡岩型。该矿床的成矿作用主要为热液交代作用，其过程分为矽卡岩期、石英硫化物期和表生期3个成矿时期。