DNA进化马尔可夫过程模型的评价与推广

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本文对DNA序列进化过程中核苷酸替代的随机模型进行了评价,对替代速率在时间和空间上不恒定的情形进行了考察和推广。Lanave等(1984)曾提出一个模型,宣称对替代的模式未做任何假定,但事实上我们证明它假定替代过程是可逆的。运用2-p、4-p和6-p模型进行的计算表明替代速度在位点间的差异会造成估计的替代数严重偏低,并且替代数越大,偏差也越大。替代模式在位点间的差异也会造成估计值偏低,但偏差不严重
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