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统筹解决水利水电工程建设与水生生物多样性保护之间的矛盾需要科学、合理地分析水利水电工程建设对水生生物多样性的影响.通过详细分析水生生态系统的构成和特点,比较全面、客观地分析了水利水电工程建设中由于水生生态系统水生生境条件改变、建造大坝的阻隔效应以及水库调峰运行等对水生生物多样性的不利影响;全面总结了我国水生生物多样性保护如法制建设、建立自然保护区、人工增殖放流、研究过鱼设施的等保护措施方面取得的成就,并分析指出现有保护实践中存在的问题,结合今后水利水电建设的发展提出了有针对性的水生生物多样性保护对策建议.