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基于改进蚁群算法的DNA双序列比对
基于改进蚁群算法的DNA双序列比对
来源 :南京师大学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cs333333
【摘 要】
:
序列比对是生物信息学中基本的信息处理方法之一.DNA序列比对分为多序列比对和双序列比对两种.本文首先分析了经典蚁群算法在双序列比对中的应用,然后针对经典蚁群算法收敛速度
【作 者】
:
李方洁
刘希玉
陈洁
【机 构】
:
山东师范大学管理与经济学院
【出 处】
:
南京师大学报:自然科学版
【发表日期】
:
2010年4期
【关键词】
:
蚁群算法
双序列比对
信息素
ant colony algorithm
pair-wise sequence alignment
pheromone
【基金项目】
:
山东省信息产业发展专项基金(2008R00038).
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序列比对是生物信息学中基本的信息处理方法之一.DNA序列比对分为多序列比对和双序列比对两种.本文首先分析了经典蚁群算法在双序列比对中的应用,然后针对经典蚁群算法收敛速度慢和陷入局部最优值等缺点进行改进,最后通过实验证明改进的智能蚁群算法在收敛速度和最优值方面都有较大的改进.
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