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利用广谱持久抗瘟基因Pi9的内含子序列设计特异功能标记Ins2-1，通过分子标记辅助选择和连续回交育种，改良早籼稻1701的稻瘟病抗性。结果表明：Ins2-1是一个显性分子标记，在Pi9基因供体亲本75-1-127和受体亲本1701之间多态性明显且稳定；Ins2-1标记基因型对稻瘟病抗性表型的选择效率为100％；通过连续回交和自交，获得了含Pi9基因且遗传背景接近受体亲本的BC6F2群体；通过对BC6F2株系标记基因型和室内接种表型鉴定，筛选出了一个抗病纯系“抗瘟1701”。