中华按蚊前酚氧化酶基因部分序列的基因结构和功能预测

来源 :寄生虫与医学昆虫学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qfcyzf2573
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前酚氧化酶是一种黑色素合成酶,是节肢动物体内的一种重要免疫蛋白.为了克隆中华按蚊Anopheles sinensis前酚氧化酶(Prophenoloxidase,PPO) 基因部分序列,根据已报道的多种昆虫 PPO 氨基酸的保守序列设计简并引物,以中华按蚊总 RNA 为模板进行RT-PCR 扩增,目的片段经 TA 克隆后测序.所得中华按蚊 PPO 基因(ASPPO) 部分序列长597 bp,编码 199 个氨基酸;与几种近缘蚊种的PPO基因序列同源性分别达57%~100%不等.经在线比对,该序列在基因组中分属两个外显子区域,中间含有一个内含子.推导的氨基酸序列含有两个铜离子结合位点,与目标序列相符,表明成功克隆出ASPPO部分序列.所得序列登录GenBank,登录号:JX295575,JX295576.推导的氨基酸序列提交瑞士蛋白质空间构象模拟平台Swiss-model,以冈比亚按蚊免疫相关前酚氧化酶为模板进行空间3D构象模拟,SPDview软件分析拉氏构象图.结果显示拉氏构象得分较高而QMEAN得分较低,近似跨膜蛋白值,提示该该蛋白是否为中华按蚊中肠和血淋巴疟原虫免疫蛋白尚不确定,需进一步研究.“,”Prophenoloxidase, a melanin-synthesizing enzyme, is considered to be an important arthropod immune protein. In order to clone the prophenoloxidase gene of Anopheles sinensis, degenerative primers were designed according to the conserved protein fragments of prophenoloxidase gene from sibling species deposited on GenBank. RNA sequence of adult An. sinensis was reverse-transcripted into cDNA strand which was amplified by PCR to get the 600 bp target fragment, the partial prophenoloxidase cDNA sequence. The target fragment was cloned into PMD18-T vector and sequenced. The partial cDNA sequences of prophenoloxidase of An. sinensis was identified and named ASPPO1, ASPPO2 respectively. The homology blasted with An. gambiae ranged from 57.58% to 100%. The two sequences were submitted to NCBI with the accessing number: JX295575, JX295576. The rooted phylogenetic tree showed the homology with PPO2 of An. gambiae. The putative amino acid fragments were submitted to Swiss-model blasting with An. gambiae to simulate the 3D spatial structure. The QMEAN score of the model showed a further study was needed to ensure whether the two PPO genes were from the midgut and hemolymph against plasmodium or not.
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