罗氏HIV-1定量检测引物SK145和SKCC1B的评估及优化

来源 :江苏大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：wreck2

【摘要】

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目的：评估罗氏HIV-1检测系统中引物SK145和SKCC1B对不同亚型HIV-1病毒定量检测的广谱性及准确性，并在此基础上对该引物进行优化。方法：下载并分析5个主要HIV-1流行亚型（B、C、A、

【作者】

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樊路娟张春霞徐庆刚张驰宇

【机构】

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江苏大学生命科学研究院,中国科学院上海巴斯德研究所

【出处】

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江苏大学学报(医学版)

【发表日期】

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2014年1期

【关键词】

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人类免疫缺陷病毒1型实时荧光定量PCR SK145 SKCC1B human immunodeficiency virus type 1 real-tim

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目的：评估罗氏HIV-1检测系统中引物SK145和SKCC1B对不同亚型HIV-1病毒定量检测的广谱性及准确性，并在此基础上对该引物进行优化。方法：下载并分析5个主要HIV-1流行亚型（B、C、A、01_AE、D）在引物SK145和SKCC1B扩增区段的对应序列，从各亚型筛选出所占比例最高的5条序列构建定蛙标准品。用梯度稀释的HIV-1各亚型标准品来评估引物SK145和SKCC1B的扩增效率。为改善引物SK145和SKCC1B对HIV-1不同亚型扩增的准确性和广谱性，我们重新设计了一对简并引物并分析其对不

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