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“十二五”以来，国家坚持把实现科技创新驱动发展作为根本任务，科研经费投入不断增加。高等院校作为提高我国科技创新能力的主要承担者之一，在其科研经费迅猛增长的同时，要不断探索科研经费管理新模式。本文针对当前我国高校科研经费使用中存在的问题，提出建立监管责任制、树立正确的经费管理导向、整合管理信息系统、增加信息透明度等措施，为新形势下高校科研经费监管提供参考和借鉴。