【摘 要】
：
目的 对变异链球菌CRISPR-Cas9系统csn2基因突变株的转录组基因表达差异进行分析.方法 培养变异链球菌UA159、csn2基因的缺失菌株Δcsn2及回补菌株.提取总RNA,采用高通量测序
【机 构】
：
口腔疾病研究国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心四川大学华西口腔医院,成都 610041
论文部分内容阅读
目的 对变异链球菌CRISPR-Cas9系统csn2基因突变株的转录组基因表达差异进行分析.方法 培养变异链球菌UA159、csn2基因的缺失菌株Δcsn2及回补菌株.提取总RNA,采用高通量测序技术,进行转录组测序,基于差异表达基因GO和KEGG数据库分析的基础上,对其参与的生物学过程进行挖掘,采用qRT-PCR的方法验证转录组测序结果.结果 转录组结果显示与UA159相比,Δcsn2中基因表达量变化在1倍以上的基因有176个(P<0.05),其中上调表达基因72个,下调表达基因104个,通过GO功能富集分析及KEGG代谢通路富集分析,发现上调和下调的差异表达基因(DEG)均参与的功能为氨基酸转运和代谢.除此之外,上调的DEG参与的生物过程主要与碳水化合物代谢、能量产生和转化、转录等有关;下调的DEG主要与脂质代谢、DNA的复制、重组和修复、信号转导机制、核苷酸转运和代谢等生物过程有关,还有部分DEG的功能尚不清楚.qRT-PCR验证发现,与UA159及Δcsn2/pDL278-csn2菌株相比,与支链氨基酸形成相关的基因leuA、leuC和leuD在Δcsn2中的表达显著下调.结论 通过转录组测序和qRT-PCR验证发现Δcsn2中与支链氨基酸合成与细胞膜通透性相关的基因表达量发生了明显变化.
其他文献
人才培养是健康中国战略的核心和基石,本文介绍了新医科战略的背景与内涵,从精准医学、转化医学、智能医学等方面论述了新医科战略对口腔医学发展的影响,分析了健康中国战略
目的:评价参仙升脉口服液对缓慢性心律失常的临床疗效.方法:缓慢性心律失常患者82例随机分为治疗组48例和对照组34例.对照组使用参麦注射液、环磷腺苷葡胺、阿托品等治疗;治
应激反应是机体应对环境变化的一种适应模式.适度应激反应可诱导机体建立有效的适应策略以提高生存能力,而过度的应激反应会引起机体应激损伤,导致多种生理或心理相关疾病的
目的:观察米非司酮配伍米索前列醇终止中期妊娠的疗效.方法:妊娠12～15周的宫内妊娠需要终止妊娠的健康孕妇350例,分为治疗组300例和对照组50例.米非司酮有两种服药方法:一种是
目的：观察高浓度的葡萄糖对人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的作用及罗格列酮的干预作用.方法：体外培养的HUVEC,根据噻唑蓝法(MTT)的试验结果,将细胞分为正常对照组、高糖组和罗格列酮
这几年葛优的头发日渐稀疏,但他的光芒却越发灿烂;不但捧走了各种奖项的奖杯,并且随着冯小刚贺岁片的成熟,而成为国内最具票房号召力的男演员之一。可令人遗憾的是,表演风格
目的 了解公立医院医生工作满意度与工作投入的水平,分析工作满意度与工作投入两者之间的交互关系,探讨工作满意度各维度如何影响工作投入,为提高公立医院医生的工作投入水平
目的 以数字减影血管造影(digital subtraction angiography,DSA)检查为金标准,探讨使用稀疏欠采样和迭代重建的3.0T时间飞跃法磁共振血管成像(time-of-flight with sparse u
目的 使用R6G-ddATP作为双脱氧荧光底物建立单碱基末端延伸(SNaPShot)-凝胶荧光法快速检测3种高危型人乳头瘤病毒(high risk human papillomavirus,HR-HPV)(HPV18、HPV33、HP
世纪演讲 19世纪临近尾声,希尔伯特已被公认为当时最杰出的数学家之一,就在新世纪即将来临时,希尔伯特收到了一份邀请,希望他在1900年夏在巴黎举行的第二届国际数学家大会上