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水疱性口炎分为印第安那型(Indiana)和新泽西型(New Jersey)。这两种血清型病毒的快速和可靠的鉴别对该病的诊断、检疫、分子流行病学调查和监测至关重要。文章按照VSV核蛋白基因序列，设计了一对两型通用引物和两型各自特异性探针。研究建立了VSV实时荧光定量PCR检测方法，对VSV细胞培养物、人工感染实验动物组织、血清样品，以及系列稀释的不同TCID50样品、其它相关或相似病毒进行鉴定，同时与常规PCR、病毒分离试验作了比较。TaqMan RT-PCR的特异性和敏感性相当于或优于对照方法。重复性和