【摘 要】
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目的 研究分析2型糖尿病(T2DM)、冠状动脉疾病(CAD)病理共有的关键调控基因及分子机制,并进一步分析上述2种疾病之间是否存在共有的调控基因,以期早诊断早干预.方法 对确诊2
【机 构】
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河北省儿童医院, 石家庄市,050031新疆医科大学第二附属医院;河北省石家庄市第三医院;河北省人民医院;河北医科大学第三医院;河北省石家庄市长安区谈固东区社区卫生服务站;
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目的 研究分析2型糖尿病(T2DM)、冠状动脉疾病(CAD)病理共有的关键调控基因及分子机制,并进一步分析上述2种疾病之间是否存在共有的调控基因,以期早诊断早干预.方法 对确诊2型糖尿病、冠状动脉疾病、同患两病患者及正常对照组的外周血单核细胞进行转录组测序(RNA-sequencing).利用基因本体论数据库(gene ontology,GO)进行功能富集分析;京都基因和基因组百科全书数据库(KEGG)进行通路富集分析.然后应用生物通用交互数据集库(BioGRID,http://thebiogrid.org/)分析获得与冠状动脉疾病和(或)2型糖尿病的差异表达基因产物互作的蛋白质,并构建蛋白质-蛋白质互作关系网络,构建可视化网络.最后对基因表达数据库(GEO)中与2型糖尿病和冠状动脉疾病相关数据集,验证冠状动脉疾病和(或)2型糖尿病中的候选差异表达基因的表达水平.结果 共计191个基因在2型糖尿病、冠状动脉疾病和两病共存条件下均差异表达;2型糖尿病特异性的蛋白质-蛋白质互作关系网络中,TCF4(Degree=169)、SKP1(Degree=164)、UBE2W(Degree=75)为枢纽蛋白;冠状动脉疾病特异性的蛋白质-蛋白质互作关系网络中,HIF1A(Degree=124)、SMAD1(Degree=112)和SKIL(Degree=94)为枢纽蛋白;通过GSE23561基因表达数据集对候选差异表达基因验证,其中HIF1A、SMAD1和SKIL三个基因在冠状动脉疾病中的表达水平均显著高于正常对照,HIF1A在2型糖尿病中显著下调.结论 共同差异表达基因主要参与病毒感染周期、抗凋亡、胰腺发育、先天免疫应答和凝血功能等生物功能和代谢通路.TCF4、SKP1与UBE2W为2型糖尿病的关键调控基因;HIF1A、SMAD1与SKIL为冠状动脉疾病的关键调控基因.冠状动脉疾病、2型糖尿病、2型糖尿病+冠状动脉疾病之间存在共有的调控基因,可能因其具有相似病理分子机制.
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