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杂交授粉优良品种和主要是自花授粉的优良品种在遗传上应该都是同质的。为了保持这类品种的整齐性，在种子生产时采用增加穗行数的方法扩繁。因此，每个穗行中与其它植株外观有不一致的被去掉，并从每行中筛选最好的植株。尽管如此，仍然有报道表明，无论是从表现型上看还是从分子水平上进行分析，都发现品种内有显著的遗传变异。McClitock曾指出，基因组是动态的，自身会对环境胁迫作出反应而进行修饰。Rasmusson也注意到，优良基因库由于基因组的弹性而具有不断提供新的遗传变异性的遗传机制。