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剑水蚤是许多鱼类的饵料，但对孵化期间的鱼类胚胎和刚出膜的“水花”却是一大敌害。它能咬破鱼卵，咬伤鱼苗，也可能放出某种毒素，造成鱼类胚胎和鱼苗的死亡。关于对鱼苗的危害，一般认为在出膜后五天内的鱼苗均可遭其攻击，但也有人观察到孵化后十五天的鱼苗均可遭受其攻击，可能是随剑水蚤的种类不同而其攻击能力也有不同的缘故。