研究射干不同部位的内生菌和根际菌的多样性,探索两者之间的关系,为筛选出功能性菌株奠定基础。采用组织块法和平板稀释法分别分离射干内生菌和根际菌,并对菌株的形态学特征或理化特性与其分子生物学分析相结合进行菌株的鉴定和多样性分析。从射干根茎及叶片中共分离出99株内生真菌和115株内生细菌,鉴定为18个属24个种。射干根茎中的内生菌菌种数(S)、分离频率(IF)、相对分离频率(RF)均高于叶片,而Shannon-Weiner多样性指数(H’)和Pielou均匀度指数(E)则低于叶片。射干根茎和叶片中的内生菌ShannonWeiner多样性指数(H’)分别为2.32,2.39,两者Sorenson相似系数(Cs)为0.63。从射干根际土壤中分离出91株根际真菌和27株根际细菌,初步鉴定为12个属20个种。根际细菌的菌种数(S)高于真菌,而多样性指数(H’)和均匀度指数(E)均低于真菌。根际菌多样性指数(H’)和均匀度指数(E)分别为2.49,0.83。射干内生菌和根际菌存在6个共有属和9个共有种,两者相似系数(Cs)为0.41。两者的真菌优势属均为镰刀菌属Fusarium,但两者的细菌优势属分别为鞘脂单胞菌属Sphingomonas、芽孢杆菌属Bacillus。射干内生菌与根际菌的种类多样且分布均匀,具有一定的种属同源性与特异性。