胰腺癌相关糖尿病致病基因表达谱的分析

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目的

探讨胰腺癌相关糖尿病(PCA-DM)致病基因的表达谱,为PCA-DM发病机制的研究提供新线索。

方法

对前期获得的4例PCA-DM患者、4例无糖尿病胰腺癌(PC)患者和4例慢性胰腺炎(CP)患者胰腺组织基因芯片分析结果进一步进行盒图、火山图、热图分析;基因相互作用网络分析;染色体定位分析;Gene ontology (GO)分析,并采用实时PCR对差异表达基因进行验证。

结果

芯片检测质量可靠。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因共2778个,其中表达倍数差异>10的有123个基因;无糖尿病PC与CP差异表达基因共7475个,其中表达倍数差异>10的有730个。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因的数量及差异倍数明显少于无糖尿病PC与CP的差异表达基因。PCA-DM和无糖尿病PC的差异表达基因大多分布于PC与CP差异表达基因的染色体位点上。GO分析显示,与药物代谢、色素沉着、GTPase活性有关的条目上调,而与蛋白代谢、核酸代谢有关的条目下调。在PCA-DM相关基因网络中,HSPA1A、CSNK1A1、EIF4A2、MYCBP2、PRKRA、NGFR等40个基因参与PCA-DM发生。TFF1、MSMB、NOX1等13个基因对PCA-DM具有潜在诊断价值。

结论

建立了PCA-DM致病基因表达谱,发现了潜在的致病基因及具有潜在诊断价值的基因。

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