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鸡球虫病与组织滴虫病虽同属于寄生虫病范畴，但其病原与病理特征有所不同。临床上鸡球虫病主要以侵害小肠及盲肠为主；而组织滴虫病除了有盲肠病变外，还以侵害肝脏为主要特征，临床上要加以区别，尤其是在两种病混合感染时，一方面要快速诊断和联合用药、积极治疗；另一方面要加强对环境的控制，彻底切断病原的传播途径，防止二次感染。采取一些综合防治措施，才能有效的控制本病，达到治愈的目的。