重大工程由建设阶段转向运维阶段的过渡期是重大工程全生命周期中具有独特属性的一个重要阶段，建立有效的过渡机制是实现建设到运维平稳过渡的重要保障。本文以港珠澳大桥由建设转向运维过渡阶段的成功管理实践作为研究对象，通过对过渡阶段大量案例文本、田野调查以及访谈数据进行编码、聚类、迭代与归纳，凝练出了重大工程过渡机制的基本框架，该框架包括规则导向、组织适应、制度调节、技术支撑、人才战略与应急迭代6个方面26类管理构念；基于复杂系统管理思想，建立了包含复杂性与整体性两大维度，深度不确定性、技术复杂性、柔性与适应性、情景鲁棒性、环境耦合性、情景整体性、关联动态性、路径迭代性8类属性的重大工程过渡阶段复杂整体性认知框架，提炼出了多准则决策、组合式协调、跨边界交互、自适应协作4个方面的重大工程过渡阶段的融合界面管理策略。港珠澳大桥由建设转向运维过渡阶段创新性实践经验的理论提炼，既是对重大工程建设与运维管理理论的有益补充与完善，也是对具有中国特色重大工程管理理论话语体系的丰富与发展，对解决重大工程全生命周期管理中的重大实践问题具有重要指导意义。