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急性腹泻大部分是由各种病毒、细菌、原虫等微生物引起，统称为感染性腹泻。常见的致泻微生物有轮状病毒，志贺菌、空肠弯曲菌、致泻性大肠杆菌、副溶血弧菌。此外，还有霍乱弧菌、沙门菌、隐孢子虫等。一旦发生腹泻特别是严重的急性腹泻，患者应及时到医院就诊，查明原因后予以针对性治疗，而不要自作主张滥用抗生素。研究表明，腹泻病人只有大约30％需要抗生素来治疗，有70％不需要也不应该用抗生素治疗。对30％的腹泻患者需要用抗生素的。