盐城滨海湿地作为以水鸟栖息地保护为主的新晋世界自然遗产地，其水鸟栖息地保护现状和面临的潜在问题备受各界关注。本研究选取盐城滨海湿地五个主要水鸟栖息地，基于野外调查获得的鸻鹬类、雁鸭类和鹭类、环境和生境等数据，综合运用地理信息技术、随机森林算法（RF）和阈值分析方法（TITAN），开展三类水鸟适宜生境识别和环境变量阈值分析。结果表明：鸻鹬类主要分布在条子泥栖息地和核心栖息地东缘；雁鸭类主要分布在条子泥和核心栖息地的农田和芦苇沼泽地；鹭类主要分布在各块栖息地的养殖塘和芦苇沼泽地；雁鸭类在五块栖息地内适宜区域面积占比均小于鸻鹬类和鹭类。影响三类水鸟在适宜区域分布的主要环境变量有生境类型、到水面距离、植被覆盖度、到芦苇距离、到主要道路/海堤距离和到农田距离，涵盖了生境类型、植被盖度和距离等环境指标。各水鸟类群内部对主要环境变量的正负响应阈值存在物种数量上的差异，同时类群间对环境变量的响应阈值也有不同表现。最后提出了维护盐城滨海湿地水鸟种群多样性和恢复栖息地景观结构的建议和方案。