PCR检测对虾白斑综合征病毒的组织特异性

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  摘 要:该研究提取了95%酒精保存的病虾组织(鳃、肌肉、表皮、附肢和复眼)的基因组总DNA,并进行了对虾白斑综合征病毒的PCR检测。琼脂糖凝胶电泳结果显示,病虾组织(鳃、肌肉、表皮、附肢和复眼)有轻微的跑带现象,鳃和肌肉比表皮、附肢和复眼的基因组总DNA电泳条带亮。PCR检测结果发现,对虾不同组织的阳性检出率高低顺序如下:鳃>肌肉=表皮>附肢>复眼。研究结果说明,鳃和肌肉可作为对虾白斑综合征病毒PCR检测的合适部位。
  关键词:对虾白斑综合征病毒;PCR;组织特异性
  中图分类号 S945 文献标识码 A 文章编号 1007-7731(2017)13-0132-02
  对虾白斑综合症病毒(White spot syndrome virus,WSSV),属线头病毒科(Nimaviridae)白斑病毒属(Whispovirus)。该病毒曾被误以为杆状病毒,曾被称为皮下及造血坏死杆状病毒等[1]。对虾白斑综合病毒可以引起对虾严重的传染病-白斑综合征(俗称白斑病),20世纪90年代以来一直严重威胁着全世界对虾的养殖安全。该病毒诱发疾病的特点是发病急、发病率高、死亡速度快。病虾停止摄食,部分濒死虾甲壳出现白色斑点,白斑综合征因此得名。世界动物卫生组织(OIE)将其列为强制通报疫病,我国将其列为一类动物疫病[1]。近年来,随着养殖环境的恶化,对虾病毒性疾病频繁暴发,严重影响了对虾养殖业的健康发展。
  对虾养殖是广东省沿海地区的一个重要产业,由于WSSV致病性强、危害性大、流行范围广,建立特异、敏感、快速的检测系统极为重要。WSSV检测方法有多种,如现场快速诊断、常规组织学、电镜、免疫学、PCR和原位杂交等。PCR具有特异性和敏感性都很高的特点,是检测WSSV的重要手段。因此,本文对PCR检测对虾白斑综合征病毒的组织特异性进行分析,为实现对虾养殖中对白斑综合征病毒的监控打下基础。
  1 材料与方法
  1.1 病料 病虾取自广东省江门市对虾养殖场,病虾为疑似白斑综合症、濒死的南美白对虾,用95%乙醇保存,运回实验室用于检测。
  1.2 试剂和引物 Tissue DNA Kit D3396购自美国OMEGA公司;Easy PureTM Quick Gel Extraction Kit和Easy PureTM Plasmid MiniPrep Kit购自北京全式金生物技术有限公司;Ex Taq DNA聚合酶、dNTP、10×buffer、氯化镁(25mmol/L)和电泳样品缓冲液均购自TaKaRa公司;引物由上海生物工程有限公司合成(表1)。
  1.4 基因组总DNA的检测 将6μL基因组总DNA和2μL电泳样品缓冲液混匀后,加入凝胶孔中,5V/cm电泳约30min,用凝胶成像仪拍照并判断结果。
  1.5 PCR鉴定 PCR反应总体积为100μL,其中含10×buffer 10μL、dNTP 2μL、氯化镁10μL、引物F1和R1各2.5μL、灭菌双蒸水62μL和待测样品10μL。将以上反应混合液混匀后稍离心,设置反应条件为:94℃预变性4min,然后94℃ 1min,55℃ 1min,72℃ 2min,30个循环;72℃延伸10min,最后4℃保温。同时设立阳性、阴性和空白对照。取反应产物5μL于含有溴化乙锭的0.8%琼脂糖凝胶。第一次PCR后,如结果为阳性,根据阳性的强弱作10~1000稀释,如结果为阴性,则不作稀释,取10μL作为第二次PCR反应的模板。同时设立阳性、阴性和空白对照。按照1.6分别加入反应组分及引物F2和R2各2.5μL,进行第二次PCR。
  1.6 琼脂糖电泳 将6μL样品和2μL电泳样品缓冲液混匀后,加入凝胶孔中,5V/cm电泳15~30min,用凝胶成像仪拍照并判断结果。第一次PCR扩增,阳性对照会得到一条大小1447bp的DNA片段,阴性和空白对照没有该核酸条带,第二次PCR后,阳性对照会得到一条大小941bp的DNA片段,阴性和空白对照没有该核酸条带。待测样品2次PCR均能得到和阳性对照同样大小的DNA片段,送上海生物工程有限公司測序,并与NCBI上的对虾白斑病毒序列进行比对,序列相似性在98%以上判为阳性;若两次PCR均无目的带或测序不对者判为阴性。
  2 结果与分析
  2.1 基因组总DNA的检测结果 为了检测组织提取的基因组总DNA降解情况,将提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳。结果显示鳃、肌肉、表皮、附肢和复眼都有轻微的跑带现象,鳃和肌肉比表皮、附肢和复眼的基因组总DNA条带亮。
  2.2 PCR检测结果 应用上述方法对50尾病虾的不同组织进行PCR检测,凝胶电泳和测序结果显示,鳃的阳性检出率为98%;肌肉和表皮的阳性检出率均为90%;附肢的阳性检出率为76%;复眼的阳性检出率为70%(表2)。
  3 讨论
  用凝胶电泳对不同组织提取的基因组总DNA质量进行检测,结果发现鳃、肌肉、表皮、附肢和复眼都有轻微的跑带现象,鳃和肌肉比表皮、附肢和复眼的基因组总DNA条带亮。试验中存在跑带现象,这说明用95%乙醇保存的样品基因组总DNA有轻微降解。用液氮保存样品,基因组总DNA降解最少。然而,大容积液氮罐在野外取样中携带不便,存在气体外泄、人员冻伤等隐患,小容积液氮罐气体容易挥发,保持时间短。因此液氮冻存不适用于长途野外样品采集工作。95%乙醇溶液配制简单,携带方便,是较佳的野外取样保存方法。
  本次研究中发现,对虾不同组织的阳性检出率高低顺序如下:鳃>肌肉=表皮>附肢>复眼。有研究指出WSSV先感染宿主血细胞,再通过血液循环将病毒粒子传播到宿主体内的其他组织[2]。WSSV感染的细胞主要分布在外胚层和中胚层起源的组织,如鳃、表皮、肌肉、前肠、后肠、胃、性腺、淋巴组织、心脏、触角腺以及神经系统的相关细胞等。由于甲壳动物特殊的摄食和呼吸方式,水中的病毒粒子可以经鳃部感染宿主,而鳃也被公认是WSSV感染较严重的部位。在本次研究中,复眼的阳性检出率最低。Lo等[3]对带复眼的眼柄进行PCR检测,结果为阴性,只有去除复眼的眼柄才为阳性,因此他推测对虾的复眼可能含有某种抑制剂,导致结果出现假阴性。
  通过本研究,建议在野外可用95%乙醇保存对虾白斑综合征病料样品,鳃和肌肉可作为WSSV PCR检测的合适部位。
  参考文献
  [1]陈爱平,江育林,钱冬,等.白斑综合征[J].中国水产,2010(10):64-65.
  [2]Di Leonardo V A,Bonnichon V,Roch P,et al.Comparative WSSV infection routes in the shrimp genera Marsupenaeus and Palaemon[J].Journal of Fish Diseases,2005,28(9):565-569.
  [3]Lo C F,Leu J H,Ho C H,et al.Detection of baculovirus associated with white spot syndrome(WSBV)in penaeid shrimps using polymerase chain reaction[J].Diseases of Aquatic Organism,1996,25:133-141. (责编:张宏民)
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