百脉根细胞亲环素电子克隆和生物信息学分析

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目的通过电子克隆技术对百脉根细胞亲环素(cyclophilin)基因进行预测。方法以大豆cyclophilin序列为探针,基于NCBI中百脉根的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。结果百脉根cyclophilin基因全长1 346 bp,包含771 bp的开放阅读框,编码256个氨基酸,该蛋白为亲水性蛋白。结论为进一步解释基因的分子功能奠定理论及实验基础。 Objective To predict the cyclophilin gene in Lotus japonicus by electron cloning technology. Methods Soybean cyclophilin sequence was used as a probe, and based on the EST database of Lotus corniculatus in NCBI and CAP3 online software, the structure and function were predicted by using the bioinformatics database and related software. Results Cyclophilin gene of Lotus japonicus was 1 346 bp in length and contained a 771 bp open reading frame encoding a protein of 256 amino acids. This gene is a hydrophilic protein. Conclusion The theoretical and experimental basis for further explaining the molecular function of genes.
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