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为了建立快速有效鉴定杂交水稻粤优938种子纯度的方法，利用广亲和基因5-n基因功能标记方法，设计了引物S5136F／S5136R，经琼脂糖凝胶电泳分析粤优938的父本、母本，分别获得了长度577bp、441bp的条带，杂种F1代获得了长度为441bp和577bp的2条带，并结合田间鉴定结果进行比较。研究发现：粤优938的分子标记和田间鉴定的纯度分别为89．5％和89．4％，2种方法鉴定的结果基本一致，没有明显的差异，说明利用S5136基因功能标记检测杂交水稻种子纯度具有可行性。