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运用亚细胞蛋白质组学的研究策略，分离纯化亚细胞结构，可以提高低丰度蛋白质在双向电泳中检出的数量。通过对比分析肝癌细胞与正常肝细胞线粒体、细胞核蛋白质组的差异表达情况，为肝癌发病机理的研究提供更多、更有价值的信息。以体外培养的人体肝癌细胞QGY-7703与正常肝细胞LO2为研究模型．通过超离心的方法分离细胞的线粒体和细胞核，双向电泳分离线粒体和细胞核的蛋白质．图像分析筛选差异表达蛋白斑点，MALDI—TOF—MS鉴定蛋白质。从线粒体、细胞核的蛋白质电泳图谱中筛选出54个候选差异表达的蛋白质斑点，质谱鉴定出2