猪流行性腹泻病毒山西分离株ORF3基因序列分析

来源 :华北农学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hljfox
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异情况,2014-2015年从山西地区11个地市收集的PEDV阳性病料中扩增到4株PEDV 的ORF3基因,并进行序列比对及遗传分析.序列分析结果表明,4株PEDV 山西分离毒株的ORF3基因与CV777毒株相比,无核苷酸插入和缺失,有部分核苷酸及氨基酸发生变异;4株PEDV 山西分离毒株的ORF3基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6%~100.0%和98.7%~99.6%,与CV777、疫苗株CV777 truncated和attenuated DR13核苷酸同源性分别为96.6%~97.0%,90.6%,97.6%~98.1%,氨基酸同源性分别为95.1%~96.0%,88.0%,97.1%~98.1%.遗传进化分析结果显示,4株PEDV 山西分离毒株与12株2010-2015年我国各地方分离的毒株和2009年分离的CH/JL/09毒株亲缘关系较近;与CV777、LZC、Brl/87和2个疫苗株(CV777truncated和attenuated DR13)亲缘关系较远.“,”To investigate the variation the ORF3 gene of Porcine epidemic diarrhea virus,4 PEDV field strains were cloned and sequenced which were isolated from 11 cities of Shanxi from 2014 to 2015.These strains were analyzed and compared with the other published PEDV strains.Sequence analysis of ORF3 gene revealed that the 4 PEDV field strains had several specific nucleotides and amino acids which were different from CV777.The nucleotide and amino acid homologies were 99.6% to 100.0% and 98.7% to 99.6% among 4 PEDV field strains.Compared with CV777,CV777 truncated,attenuated DR13,the nucleotide homologies were 96.6% to 97.0%,90.6%,97.6% to 98.1%,and amino acid homologies were 95.1% to 96.0%,88.0%,97.1% to 98.1%,respectively.Phylogenetic analysis showed that the 4 PEDV field strains were genetically close to other prevalent strains from other parts of China from 2010 to 2015,CH/JL/09 isolated in 2009;However,there were genetically different from CV777,LZC,Brl/87,CV777 truncated,attenuated DR13.
其他文献
建筑色彩作为高校校园建设的重要部分,对于传承校园文化,营造和谐的校园环境具有重要意义.通过研究河北农业大学东、西校区的建筑色彩,进一步了解国内外城市色彩规划的理论以
近些年来,各地营造了大面积杜仲林,但由于生产上重栽轻管,忽视质量,管理粗放,形成了一些低产低效林,严重地影响了杜仲的生产发展.为提高经营效益和产品的经济价值,现将从实践
水稻旱育秧施用壮秧剂具有简化育秧程序、培育矮壮秧、防治立枯病等功效 ,是水稻旱育稀植栽培技术推广的发展方向。为贵州省农业技术推广总站研制了一批新型壮秧 ,进行产业开
分泌型核酸酶基因ssnA是近年来研究发现的一种脱氧核糖核酸酶,被认为是一种猪链球菌2型(SS2)潜在的毒力因子.为了分析ssnA基因对于SS2毒力的影响,通过体外构建具有同源臂的重
依据全国铁路行业的要求,适应现阶段及未来铁道机车相关岗位的需求,创新铁道机车车辆制造与维护专业资格前置性的人才培养模式,扩宽学生的就业领域,缩短本专业学生的岗前培训
将粗山羊草细胞质导入普通小麦,研究其对普通小麦细胞核的遗传效应。结果表明,粗山羊草细胞质对普通小麦开花习性具有优良的作用;能增加小麦的株高,提高小穗数、穗粒数、结实率
旱育稀植是水稻高产的一项栽培技术 ,特别是对高寒山区稻田和冷荫烂锈田的水稻生产更具有增产幅度大的作用。为了探索旱秧在不同酸度土壤下的生长素质与调酸技术 ,更好地培育
针对陇中丘陵区水土流失严重、土地旱薄相连产出低、经济发展缓慢较贫困的突出问题,紧紧围绕降水资源的高效开发利用,展开研究,明确了陇中丘陵区种植业结构调整的思路和对策;
降水是定西半干旱区的唯一水资源,提高降水利用是当前旱地农业研究的中心内容.降水少、分布不均、年际变率大是该区降水的基本特点.春小麦是当地的主要作物,占播种面积的45%~5
小麦高光效品种倾向于有效地利用光温水 ,而不是更多地利用光温水 ;夏玉米高光效品种既能更多地利用光温水 ,又能更有效地利用光温水。两熟高光效品种合理组合、适度增密、均