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纳板河流域已知有八个植被类型，１２个亚型，２４个群系。大约１７８３种（变种、亚种）高等植物，占云南省高等植物的１２％。珍稀濒危植物种类较多，计有３３种，占云南省珍稀濒危植物种类的２２％。其中，一级保护植物１种，二级保护植物４种，三级保护植物２８种。自一九九二年在该流域建立省级自然保护区以来，管理部门、当地政府和科研人员采取了一系列措施，对该流域的植物多样性进行保护。