旨在研究山羊胃肠道不同部位微生物组成及分布特征,以期为探索胃肠道不同部位微生物的营养代谢功能奠定基础。选择山羊胃肠道具有明确已知功能特征的甲烷菌和细菌来进行qRT-PCR定量研究。细菌中又选择了2个属(乳杆菌和双岐杆菌),5个种(4种纤维降解菌和栖瘤胃普雷沃氏菌)。选取4只体况良好、年龄相同(1岁半左右)、体重相近((20.0±1.2)kg)的浏阳黑山羊作为试验动物的4个重复。同时屠宰4只羊,取瘤胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠的食糜,提取总DNA,通过构建重组标准质粒来对这些微生物进行绝对qRT-PCR定量研究。结果,本研究已成功构建细菌及甲烷菌的标准质粒。健康状况良好的成年浏阳黑山羊胃肠道不同部位的微生物存在差异(P<0.01),同时胃肠道相同部位的微生物在数量上也存在着差异。除溶纤维丁酸弧菌外,检测的微生物均是在瘤胃中最多。在后肠道、空肠和十二指肠的微生物数量最少,回肠的微生物较多,以盲肠、结肠和直肠中的微生物最多。山羊胃肠道不同部位重要功能微生物的数量分布情况差异极显著(P<0.01),但总体上是瘤胃最多,盲肠、结肠、直肠居中,回肠次之,十二指肠和空肠最少。重要功能微生物分布特征的差异为探索胃肠道不同部位微生物的营养代谢功能奠定基础。