基于5种拓扑分析方法鉴定与口腔鳞状细胞癌相关的生物标志物

来源 :西北民族大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vince_yang_666666
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口腔鳞状细胞癌分子机制复杂,早期检测困难,因此探索其潜在生物标志物及预后相关hub基因具有重要意义.本研究从美国国家信息中心(NCBI)下载了一组口腔鳞状细胞癌(n=3)和正常组织(n=3)的转录本测序(RNASeq)表达数据(GEO),通过edgeR方法鉴定出1269个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),包括331个上调基因和938个下调基因.通过STRING V11数据库构建了差异表达基因的蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过CytoHubba插件中
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