【摘 要】
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针对细胞内基因功能模块化的现象,定义了'基因功能模块'和'特征功能模块'两个概念,并基于这两个概念提出一种'与实验条件相关的基因功能模块聚类算法
【机 构】
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哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室,哈尔滨医科大学医学数学与生物医学工程学教研室
【基金项目】
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国家自然科学基金,国家高技术研究发展计划(863计划),黑龙江省科技攻关项目,黑龙江省哈尔滨市科技攻关项目,黑龙江省自然科学基金,国家'211'工程建设项目
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针对细胞内基因功能模块化的现象,定义了'基因功能模块'和'特征功能模块'两个概念,并基于这两个概念提出一种'与实验条件相关的基因功能模块聚类算法'.该算法综合利用基因功能知识与基因表达谱信息,将基因聚类为与实验条件相关的基因功能模块.向基因表达谱中加入水平逐渐升高的数据噪音,根据基因功能模块对数据噪音的抵抗力,确定最稳定的基因功能模块,即特征功能模块.加噪音实验显示,在基因芯片技术可能发生的噪音范围内,该算法对噪音的稳健性优于层次聚类和模糊C均值聚类.将模块
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