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提出了在硬件产品上运行BLAST算法的方案,认为可以使BLAST达到目前为止最快的速度。它是在由NVIDIA发布的CUDA编程环境上执行的。做了详尽的模拟试验,在一个3GHz英特尔奔腾IV处理器上运行,比较了BLAST和SSEARCH的执行。方案与最新公布的GPU执行情况和一个SIMD解决方案进行了比较,测试表明,实现了在硬件产品上获得更大速度的目的,也降低了大规模比对的执行成本。