枳壳EST-SSR标记的开发

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户：baochangjingmao

【摘要】

：

GenBank上已公布的枳壳EST序列为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源。本研究利用在线SSR鉴定软件SSRIT分析来自枳壳EST数据库的11029条Unigene序列。分析结果共发现327条E

【作者】

：

杨春霞温强叶金山朱培林

【机构】

：

江西省林业科学院

【出处】

：

分子植物育种

【发表日期】

：

2011年1期

【关键词】

：

枳壳表达序列标签(EST) 简单重复序列(SSR) Citrus aurantium L Expressed sequence tags（EST） Sim

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GenBank上已公布的枳壳EST序列为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源。本研究利用在线SSR鉴定软件SSRIT分析来自枳壳EST数据库的11029条Unigene序列。分析结果共发现327条EST序列含有348个SSR位点,占总数的2.96%。其中,三核苷酸重复的SSR类型最多,共有161个,占检索总数的46.26%。Primer 3.0设计合成58对EST-SSR引物,其中36对能扩增出产物,6对引物产生多态性分离,分别占所设计引物总数的62.07%和10.34%。本文研究成果为今后枳壳遗传多样

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