基于生物信息学探索肺腺癌预后相关基因及免疫浸润分析

来源 :中国免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：daiguangying

【摘要】

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目的:筛选出肺腺癌(LUAD)的预后相关因子,并分析LUAD中免疫细胞浸润情况。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载LUAD转录组RNA——Seq数据集,应用反卷积算法(CIBERSORT)和估计算法(ESTIMATE)计算患者肿瘤浸润性免疫细胞(TIC)的比例以及免疫和基质成分的数量。利用R软件鉴定LUAD患者与正常人的差异表达基因(DEGs),并进行功能和通路富集分析。采用单变量Cox回归分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建方法对DEGs交叉分析,确定LUAD预后相关因子,并选择其

【作者】

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黄宏玉巫艳彬覃寿明

【机构】

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广西医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科

【出处】

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中国免疫学杂志

【发表日期】

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2021年11期

【关键词】

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CD22 肺腺癌预后因子免疫细胞浸润肿瘤免疫微环境

【基金项目】

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国家自然科学基金(地区项目,81360018),桂卫适宜技术项目(S201659),卫健委自筹项目(Z20180970)。

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