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用１２０个含１０碱基的随机引物，对长江，珠江，黑龙江三大水系的草鱼产卵场及太湖中捕获的草鱼进行覆盖性的ＲＡＰＤ分析，实验共扩增出２３４６条重复性高而清晰的ＤＮＡ带，获得多态性片段８４４条。结果表明，每一水系的草鱼种群均有其特征基因图谱，可作为种群鉴定的依据；统计学分析后绘制的遗传距离树状图与经典的数量遗传，质量遗传分析结果相吻合。