宽体金线蛭基因组SSR序列特征分析及其分子标记开发

来源 :南方农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gongshurong20090907
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【目的】分析宽体金线蛭基因组SSR序列特征,并开发多态性SSR分子标记,为宽体金线蛭种质遗传多样性分析及良种选育等提供有效的分子标记。【方法】利用基因组denovo测序技术对宽体金线蛭基因组进行扫描,通过序列拼接得到基因组序列,利用TandemRepeatsFinderv4.09查找拼接序列SSR位点,分析SSR序列特征并使用PRIMER3Input(version2.3.7)设计引物,随机选择三碱基、四碱基和五碱基SSR分子标记引物50对对8份宽体金线蛭DNA样品进行PCR验证,并以多态性SSR分子标记
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