目的 探讨胃癌亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与微卫星不稳的关系.方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测122例胃癌和101名正常对照的MTHFR基因C677T和A1298C多态性;采用PCR为基础的方法检测微卫星不稳定性(MSI).结果MTHFR C677T多态性可分为677CC、677CT和677TT三种类型.胃癌组3种基因型频率分别为47.5%、39.3%和13.1%;对照组分别为48.5%、42.6%和8.9%,两组相比差异无统计学意义(P＞0.05).以677CC基因型做为参考,胃贲门癌677CT基因型OR值为0.38,95%CI:0.15～0.98;TT基因型OR值为0.26,95%Ci:0.03～2.18;677CT+TT基因型OR值为0.36,95%CI:0.07～0.98.胃体癌677TT基因型OR值为3.03,95%CI:1.07～8.65.MTHFR A1298C多态性可分为1298AA、1298AC和1298CC 3种类型.胃癌组3种基因型频率分别为59.8%、36.1%和4.1%;对照组分别为57.4%,37.6%和5.0%,两组相比差异无统计学意义(P＞0.05).以1298AA基因型的OR值为1.00,胃窦癌AC基因型的OR值为0.87,95%CI:0.42～1.82,CC基因型的OR值为0.41,95%CI:0.05～3.72.MTHFR 677TT基因型胃癌与微卫星不稳显著相关(P＜0.05),而MTHFR A1298C多态性与微卫星不稳无关(P＞0.05).结论重庆地区人群中MTHFR C677T多态性是胃贲门癌的保护因素,是胃体癌的危险因素;MTHFR A1298C多态性可能是胃窦癌的保护因素;677TT基因型胃癌的发生可能涉及到MSI途径。