长白山鸡爪苓菌核cDNA文库的部分EST序列生物信息分析

来源 :延边大学农学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kaji2009
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探求由鸡爪苓菌丝体形成菌核的关键结构基因,为深入研究该珍稀药用真菌的生长发育、代谢调控以及优质种质资源的开发、利用与保护提供理论基础。从鸡爪苓菌核全长cDNA文库中随机筛选500个单独克隆进行单方向测序,选取3条全长的ESTs序列进行蛋白质功能预测,并进行生物学信息分析。结果表明:获得455条有效的EST序列,经聚类分析得到单基因簇共349条,文库冗余度为23%;参照拟南芥功能分类标准,将BLASTx比对结果中具有已知功能的78条单基因簇分成9类,分别是代谢、能量、转录、蛋白质合成、细胞结构、胞内运输、信
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