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目的了解惠州市手足口病肠道病毒的感染情况,为制定预防和控制肠道病毒感染策略提供依据。方法采集2011年7—12月我院送检的疑似手足口病患者的粪便、肛拭子、咽拭子和脑脊液等标本2238份，应用荧光RT-PCR技术检测样本中的肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒 A组16型(CA16)。结果共检出607份 EV阳性标本,198份 EV71阳性标本，7份CA16阳性标本，阳性率分别为63.19%,33.61％和2.33%，差异有统计学意义（P<0.05）；男女患者的感染率分别为61.12％和38.88％，差异有统计学意义（P <0.05）；7-10月份是2011年下半年手足口病发病高峰期；0-4岁的儿童是手足口病的高发人群。结论惠州市2011下半年手足口病的病原以肠道病毒71型为主；7-10月份是手足口病发病高峰期；0-4岁儿童是感染肠道病毒的高危人群。