【摘 要】
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从NCBI中下载了12 184条香菇(Lentinula edodes)表达序列标签(expressed sequence tag,EST)序列,处理后得到全长3 681 177 bp的4 684个Unigene。在其中共发掘出142个简单重复序列
【机 构】
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安徽农业大学生命科学院,浙江林学院农业与食品学院
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从NCBI中下载了12 184条香菇(Lentinula edodes)表达序列标签(expressed sequence tag,EST)序列,处理后得到全长3 681 177 bp的4 684个Unigene。在其中共发掘出142个简单重复序列(simple sequencerepeat,SSR),分布于120条EST中,分布频率为2.99%(平均分布距离:25.924 kb)。其中,单、二、三核苷酸重复是主要的重复类型,A/T,AG/CT,ACG/CTG是单、二、三核苷酸的主要重复基序,分别占所有E
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