【摘 要】
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目的 探索IS Ecp1转座单元的类型及其转座机制。方法 采用BLAST比对分析GenBank库中IS Ecp1及其下游bla CTX-M所处的基因环境。通过ResFinder预测耐药基因,BLASTN/BLASTP等对
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81501779),河南省高等学校重点科研项目(18A320024),开封市发展计划科技攻关项目(1703006)
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目的 探索IS Ecp1转座单元的类型及其转座机制。方法 采用BLAST比对分析GenBank库中IS Ecp1及其下游bla CTX-M所处的基因环境。通过ResFinder预测耐药基因,BLASTN/BLASTP等对ORF和假基因进行核实与信息完善,并利用ISfinder对移动元件进行精细注释,最后运用Inkscape 0.48.1绘图。结果 bla CTX-M常位于移动元件IS Ecp1下游,二者可形成完整的转座单元,该转座单元主要可分为6类,即:IS Ecp1-bla CTX-M-Δorf477转
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