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目的:探究莫沙必利与多潘立酮治疗功能性消化不良的临床疗效。方法:在本次研究中选择2014年9月-2015年7月我院收治的77例功能性消化不良患者为研究对象,将其分为甲组和乙组,甲组38例患者,乙组39例患者。甲组采用莫沙必利进行治疗,乙组采用多潘立酮进行治疗,对临床疗效进行对比分析。结果:在本次研究中,甲组的有效人数32例,治疗总有效率为84.1%,乙组的有效人数有25例,治疗总有效率为64.1%,甲组的治疗效果明显优于乙组,比较结果差异性明显,具有统计学意义(p<0.05)。甲组的不良反应率为5.2%,乙组的不良反应率为15.4%,乙组的不良反应率明显高于甲组,比较结果差异性明显,具有统计学意义(p<0.05)结论:对功能性消化不良的患者采用莫沙必利进行治疗,不良反应比较少,值得临床推广和应用。