基于高通量测序的野生毛葡萄转录组SSR信息分析

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：caiguoxi

【摘要】

：

利用毛葡萄叶片高通量转录组测序数据进行简单重复序列（simple sequencerepeat,简称SSR）搜索并对其所在的序列进行注释,从而为毛葡萄分子标记开发提供有效信息.从35238条质量较

【作者】

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方辉蒋胜理曲俊杰周思泓潘凤英

【机构】

：

广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,广西农业科学院

【出处】

：

江苏农业科学

【发表日期】

：

2017年20期

【关键词】

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毛葡萄转录组高通量测序简单重复序列(SSR)

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利用毛葡萄叶片高通量转录组测序数据进行简单重复序列（simple sequencerepeat,简称SSR）搜索并对其所在的序列进行注释,从而为毛葡萄分子标记开发提供有效信息.从35238条质量较高的umgene中搜索到4428个SSR位点,对这些序列进行基因本体（geneontology,简称GO）、同源蛋白质簇（cluster of ortholo gousgroups of proteins,简称COGs）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyslopedia of genes and g

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