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目的 探讨上海地区丙型肝炎病毒(HCV) 1b亚型感染者E2区的高变区1(HVR1)和高变区2(HVR2)、双链RNA激活的蛋白激酶-真核翻译启动因子磷酸化同源区域(PePHD)及其邻近区域的基因序列与干扰素应答的相关性.方法收集上海地区24例HCV1b慢性感染者在α干扰素治疗前后及随访过程中的血清标本,用逆转录-聚合酶链反应扩增E2区的HVR1、HVR2、PePHD及其邻近区域的基因并进行测序和氨基酸同源性分析.结果治疗前的HVR1区氨基酸序列高度变异,基于HVR1序列的种系发生树提示序列变化与干扰素应答类型无关.持续应答组(SR)、无应答组(NR)和复发组(TR)治疗前的HVR2区平均氨基酸变异数分别为2.0、1.0和1.5,统计学分析显示SR组与NR组差异有显著性(t=3.098, P<0.05).治疗前的PePHD序列高度保守,无1例存在氨基酸变异.观察4例NR患者治疗过程中的PePHD序列,也未发现有任何氨基酸的突变.进一步比较PePHD邻近区域的氨基酸序列发现存在个别位点的变异(平均氨基酸变异SR组6.67,NR组5.75,TR组7.43),但变异的多少与疗效无关(SR组∶NR组t=1.413,P=0.195; SR组∶TR组 t=1.706,P=1.107; TR组∶NR组 t=0.682,P=0.504).结论与HCV E2基因的HVR1区、PePHD区及其邻近区域序列与患者对干扰素的应答无相关性比较, HVR2区的序列变化可能与干扰素应答存在一定的相关性。