基于大规模文本的蛋白质交互关系自动提取

来源 :计算机应用 | 被引量 : 8次 | 上传用户：c1061088

【摘要】

：

针对目前蛋白质交互(PPI)关系提取方法仅以单句中的信息为主要依据的问题,提出一种基于大规模文本的蛋白质交互关系自动提取的方法。首先通过对大规模生物医学文本的自动搜索建立目标蛋白质对的签名档,将蛋白质交互关系抽取转化为文本自动分类问题;然后提取签名档中的重要特征,建立蛋白质对的向量空间模型(VSM);最后采用支持向量机(SVM)对签名档进行分类。比较了四种对向量的特征进行加权和特征选择的方案。实验

【作者】

：

封二英牛耘魏欧

【机构】

：

南京航空航天大学计算机科学与技术学院

【出处】

：

计算机应用

【发表日期】

：

2012年S1期

【关键词】

：

蛋白质交互大规模文本向量空间模型支持向量机文本分类 Protein-Protein Interaction （PPI） large scale tex

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目（61170043）,教育部高等学校博士学科点专项基金资助项目（20103218120024）.

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