中国西南野生生物种质资源库是国家大科学工程,其保藏的野生种质资源是人类社会可持续发展所依赖的战略资源。本文结合国家对战略种质资源的保护和持续利用研究的需求,利用当前先进的e-Science的科学理念和信息技术,针对如何快速、有效地鉴定和发掘优异基因这一科学问题,以重要野生禾本科植物的比较基因组学研究为例,提出实施e-Science应用环境的建设方案。通过对种质资源库保藏与创新活动的全过程分析,抓住4个关键环节(采集计划、监测评价、实验分析、创新研究),深入了解每个环节上的信息需求,合理部署科研工具、数据标准、模型分析和计算过程,为科学家和支撑服务人员打造一个全面服务于种质资源采集、整理、保存、共享、传递和创新的软硬件结合、协同工作的信息化科研环境。该项工作的实施将有利于提升种质资源库的国际地位,为我国在国际生物战略资源竞争做出贡献。