【摘 要】
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目的利用ATAC-Seq技术研究人骨髓间充质干细胞(hMSCs)成脂分化过程中染色质开放性的动态变化。方法第6代人源hMSCs经成脂诱导剂分别刺激0 d、3 d、5 d和7 d。收集各组细胞,转座酶Tn5捕获DNA序列并测序,生物信息学分析各组间染色质开放区域数量分布、转录因子结合序列(motif)、邻近基因功能(GO)及相关信号通路(Pathway)。结果在h MSCs成脂分化早期的不同时间点,细胞染色质开放区域数量发生显著动态变化;各组功能性区域Peak分布主要富集在转录起始点(TSS)附近;Moti
【机 构】
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江西省系统生物医学重点实验室,九江学院医学院组织胚胎学与医学遗传学教研室
【基金项目】
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国家自然科学基金(81860165)。
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目的利用ATAC-Seq技术研究人骨髓间充质干细胞(hMSCs)成脂分化过程中染色质开放性的动态变化。方法第6代人源hMSCs经成脂诱导剂分别刺激0 d、3 d、5 d和7 d。收集各组细胞,转座酶Tn5捕获DNA序列并测序,生物信息学分析各组间染色质开放区域数量分布、转录因子结合序列(motif)、邻近基因功能(GO)及相关信号通路(Pathway)。结果在h MSCs成脂分化早期的不同时间点,细胞染色质开放区域数量发生显著动态变化;各组功能性区域Peak分布主要富集在转录起始点(TSS)附近;Moti
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